自20世紀50年代以來，全球範圍內已有大量流行病學研究證實，吸菸是導致多種疾病的危險因素，目前已成爲全球前8位死因(缺血性心臟病、腦血管疾病、下呼吸道感染、慢性阻塞性肺疾病、艾滋病、腹瀉、結核、氣管/支氣管肺癌)中除了艾滋病和腹瀉外，其他六種疾病的主要危險因素。
吸菸幾乎損害人體全部重要器官：呼吸系統、循環系統、神經系統、泌尿系統及其它重要臟器。這些損害，男女是相同的。然而女性特殊的身體結構和孕育下一代的生理特點，使得吸菸對女性還造成一些特殊傷害：吸菸可使女性容顏早衰，月經紊亂，痛經，雌激素低下，絕經期提前，骨質疏鬆，尿失禁。
女性90%的肺癌、75%的慢性阻塞性肺病和部分冠心病，都與吸菸有關;吸菸婦女死於乳腺癌的機率比不吸菸婦女高25%。女性吸菸合併口服避孕藥，可以使心臟病、中風和其它心血管疾病的發病風險提髙10倍。這在40歲以上女性中尤爲顯著。與男性相比，一些疾病的發生發展女性會更加嚴峻：
吸菸女性出現肺氣腫和慢性支氣管炎等慢性阻塞性肺病的危險更大。在更年期之後，吸菸女性發生冠心病和由於骨密度低導致的骨折的風險更大。
女性戒菸更爲艱難
菸草中的成癮物質是尼古丁，所以它也用於戒菸的替代療法。但女性代謝尼古丁的速度比男性快，使用避孕藥的女性和孕婦代謝尼古丁的速度比其她女性更快，因此，便降低了尼古丁貼片和口膠等戒菸替代治療措施的效果，還會導致女性更強烈的噁心、眩暈和虛弱等不適感。致使女性比男性更難戒菸。
孕婦吸菸重損胎兒
孕婦吸菸易引起自發性流產、早產、死產或宮外孕;會嚴重影響胎兒發育的各個階段，引起胎兒發育遲緩、先天畸型(如脣裂、顎裂、無腦兒、先天性心臟病、肢體殘缺)，影響孩子的智力及發育。研究表明，妊娠婦女吸菸，其嬰兒出生體重平均減少200g，嬰兒低體重出生率是不吸菸婦女的2倍。
