三九天艾灸的最佳時間是一九、二九、三九等時間段進行，還應選擇每天陽氣最旺盛時艾灸。
三九天是從冬至後開始算起。第一個九天爲一九，第二個九天爲二九，第三個九天爲三九，依次到九九。三九天是一年中最冷的時候，此時陽氣斂藏、氣血不暢、皮膚乾燥、毛孔閉塞，進行艾灸可溫陽益氣，提高機體免疫力。在三九天艾灸時，通常是在一九、二九、三九進行，每一個九天至少進行一到兩次，如自身情況特殊，可進行三到四次。爲了提高療效，還可在一九前九天進行預灸，三九後九天進行加強灸。
在三九天進行艾灸時，最好能選擇一天當中陽氣最旺盛的時間段進行艾灸，如上午出太陽後或中午，此時艾灸的效果會更好。每次艾灸時間不宜過長，最長不可超過一個小時，否則會造成身體虧損。
