正確使用加溼器並無什麼危害，但錯誤使用可造成以下危害，如：
1、患有咽喉炎使用
本來就患有嚴重咽喉炎的患者，如果不積極治療，再開加溼器增加屋內的溼度，容易使空氣中的病毒、細菌傳播得更快，導致患者咽喉炎病情加重，因爲咽喉炎發病與病毒、細菌感染可能有一定的關係，另外對於部分有肺炎、支氣管炎的，用加溼器時也要適當的注意。
2、在加溼器中添加消毒劑
部分人認爲在加溼器中加消毒劑霧化，可以更好的爲室內空氣消毒殺菌，但這些消毒劑成分被吸入後對人體的肺部和支氣管上皮細胞也會產生刺激，如果濃度過高，可能會導致上呼吸道損害，出現喉嚨幹痛等現象。
3、長期使用不清潔
加溼器如果長時間使用但不清潔的話，裏面的細菌等微生物會大量繁殖，然後隨着霧化的水汽進入空氣中，繼而危害健康。建議每天換水一次，每週清潔加溼器一次。
4、室內溼度高仍然使用加溼器
使用加溼器的溼度過高不能超過60%，否則會加重關節炎患者的不適，還會加速細菌等微生物的繁殖滋生，免疫力低的人羣可能出現咽喉痛、胸悶等情況。建議使用加溼器的時候在屋內放在溼度計，保證在使用加溼器時室內的溼度不要超過60%；保持室內的潔淨並且經常通風；並且有關節炎、糖尿病的人羣最好不要使用加溼器。
