異位妊娠的診斷，通常可以通過體徵就可以判斷出來。如果患者的體徵符合以下標準，基本就可以判斷是異位妊娠了。
1、一般情況：腹腔內出血較多時，呈貧血貌。大量出血時，患者可出現面色蒼白，脈快而細弱，血壓下降等休克表現。體溫一般正常，休克時可略低，腹腔內血液吸收時可略高，但不超過38℃。
2、腹部檢查：下腹部有明顯壓痛及反跳痛，尤以病側爲甚，但腹肌緊張稍輕。出血較多時，叩診有移動性濁音。有些患者下腹部可觸及包塊，若反覆出血並積聚，包塊可不斷增大變硬。
3、盆腔檢查：陰道內常有少量血液。輸卵管妊娠未發生流產或破裂者，可觸及脹大的輸卵管及輕度壓痛。輸卵管妊娠流產或破裂者，陰道後穹隆飽滿，有觸痛，宮頸舉痛明顯。
當診斷有困難時，若陰道流血淋漓不斷，腹痛加劇，盆腔包塊增大以及血紅蛋白逐漸下降等，醫生一般會採用以下輔助檢查有助於確診。
1、孕酮測定：異位妊娠的血清P水平偏低，但在孕5～10周時相對穩定，單次測定即有較大的診斷價值，儘管正常和異常妊娠血清P水平存在交叉重疊，難以確定它們之間的絕對臨界值，但血清P水平低於10ng/m1（放免測定），常提示異常妊娠，其準確率在90%左右。
2、妊娠試驗：妊娠試驗可爲陽性。
3、陰道後穹隆穿刺：若抽出暗紅色不凝固血液，說明有血腹症存在。陳舊性宮外孕時，可以抽出小血塊或不凝固的陳舊血液。無內出血、內出血量少、血腫位置較高或直腸子宮陷凹有粘連時，可能抽不出血液，因而穿刺陰性不能否定輸卵管妊娠存在。內出血量多，腹部檢查有移動性濁音，亦可經下腹一側作腹腔穿刺。
4、超聲診斷：B型超聲顯象對診斷異位妊娠有幫助。異位妊娠的聲像特點：1、異位妊娠時，子宮雖增大但宮腔內空虛，宮旁出現低迴聲區。2、B超顯像一般要到停經7周時，才能查到胚芽與原始心管搏動。3、輸卵管妊娠流產或破裂後，則宮旁回聲區缺乏輸卵管妊娠的聲像特徵。
5、子宮內膜病理檢查：是依靠診斷性刮宮協助診斷，目的在於排除宮內妊娠流產。
6、腹腔鏡檢查：有助於提高異位妊娠的診斷準確性。腹腔內大量出血或有休克者，禁作腹腔鏡檢查。
7、診斷性刮宮：在不能排除異位妊娠時，可行診斷性刮宮術，獲取子宮內膜進行病理檢查。但異位妊娠的子宮內膜變化並無特徵性，可表現爲蛻膜組織，高度分泌相伴有或不伴A–S反應，分泌相及增生相多種。子宮內膜變化與患者有無陰道流血及陰道流血時間長短有關。因而單靠診斷性刮宮對異位妊娠的診斷有很大的侷限性。
8：其他生化標記：近年來還有將檢測血清CA125與β–HCG結合，發現血清CA125水平有隨着β–HCG水平降低而升高的趨勢，可用於異位妊娠有無流產、胚胎是否死亡的鑑別。
在診斷異位妊娠時，要與以下病症鑑別診斷：
1、早期妊娠先兆流產先兆流產腹痛一般較輕，子宮大小與妊娠月份基本相符，陰道出血量少，無內出血表現。B超可鑑別。
2、卵巢黃體破裂出血黃體破裂多發生在黃體期，或月經期。但有時也難與異位妊娠鑑別，特別是無明顯停經史，陰道有不規則出血的患者，常需結合β–HCG進行診斷。
3、卵巢囊腫蒂扭轉患者月經正常，無內出血徵象，一般有附件包塊病史，囊腫蒂部可有明顯壓痛，經婦科檢查結合B超即可明確診斷。
4、卵巢巧克力囊腫破裂出血患者有子宮內膜異位症病史，常發生在經前或經期，疼痛比較劇烈，可伴明顯的肛門墜脹，經陰道後穹隆穿刺可抽出巧克力樣液體可確診，若破裂處傷及血管，可出現內出血徵象。
5、急性盆腔炎急性或亞急性炎症時，一般無停經史，腹痛常伴發熱，血象、血沉多升高，B超可探及附件包塊或盆腔積液，尿HCG可協助診斷，尤其經抗炎治療後，腹痛、發熱等炎性表現可逐漸減輕或消失。
6、外科情況急性闌尾炎，常有明顯轉移性右下腹疼痛，多伴發熱，噁心嘔吐，血象增高；輸尿管結石，下腹一側疼痛常呈絞痛，伴同側腰痛，常有血尿，結合B超和X線檢查可確診。
