注射乙肝疫苗後一般不會影響日常工作和生活，至今未有引起嚴重副作用的現象，只有少數人出現發熱、乏力、噁心、嘔吐、腹痛、腹瀉、皮疹、接種部位紅腫、硬結、疼痛，手臂酸重等與一般疫苗接種無異的輕微反應，或出現暫時性的局部淋巴結腫大或淋巴管炎等局部不良反應，多在12－72小時內自行緩解消退。這是接種後的正常反應，其表現強度隨疫苗和接種個體體質而異。不需要特殊治療，熱敷並避免沾水防止感染即可。
