雖然芹菜本身有許多營養，不過醃製加工過程中可能會造成一些副作用，經常吃醃芹菜還可能對健康帶來一些危害。
首先，芹菜在研製過程中本身具有的維生素C會遭到破壞，醃製時間過長甚至或導致維生素c全軍覆沒。維生素c 是維持人體的重要元素，長期吃醃菜，會因缺乏維生素C而引起身體的各種疾病。
其次，醃芹菜中鹽分過高會影響人體的粘膜系統，傷害我們的腸胃，導致腎負擔過重，最終不僅不能通過芹菜降壓，還有可能因爲鹽分過高引發高血壓呢。
吃太多醃芹菜還有致癌的風險。醃製芹菜需要加入大量的鹽，而鹽中是含有雜質的，其中就包括硝酸鹽。硝酸鹽在發酵的過程中容易被微生物還原成亞硝酸鹽，而亞硝酸鹽是致癌物質，所以吃太多的醃芹菜有患癌症的風險。
